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中药学论文_钩藤属植物分子鉴定的DNA条形码筛

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文章摘要:目的应用分子生物学鉴定技术，筛选出应用于鉴定钩藤属物种的最佳DNA条形码，建立快速、准确、便捷的钩藤属植物鉴定方法。方法本研究从广东、广西等地收集了8个钩藤属物种的叶片、茎枝作为实验材料，共计44份样品。提取样品总DNA，分别对条形码ITS、matK、psbA-trnH、rbcL、trnL-trnF序列进行扩增、测序、拼接、校对；利用MEGA7.0分析比对序列特征；基于TaxonDNA计算种内、种间的遗传距离以分析barcodinggap及BestMatch、BestCloseMatch评估DNA条形码的鉴别能力；使用MEGA7.0、Phylosuite等软件构建单条形码及组合条形码的最大似然法（MaximumLikelihood，ML）、最大简约法（MaximumParsimony，MP）、贝叶斯推断法（Bayesianinference，BI）系统发育树。结果条形码ITS、matK、psbA-trnH、rbcL、trnL-trnF序列均扩增成功且具有较高的测序成功率，其中psbA-trnH具有最多的变异位点，ITS次之，rbcL最少；BestMatch、BestCloseMatch与Barcodinggap分析结果显示：5个单一条形码中，ITS鉴定钩藤属物种效果突出且具有明显的Barcodinggap，而组合条形码ITS＋rbcL序列表现更为优异。基于所有单一条形码构建的系统发育树，ITS序列的物种鉴别成功率最高，能够准确鉴定8个钩藤属物种；基于组合条形码构建的系统发育树，ITS＋rbcL序列具有最高的平均节点支持率，且该序列集包含的11个钩藤属物种均能单独聚为一支。结论应用ITS＋rbcL的序列组合能够实现钩藤属不同物种的准确鉴定。

文章关键词:

论文分类号:R282.5

文章来源：《植物研究》网址: http://www.zwyjzz.cn/qikandaodu/2022/0125/2298.html