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农作物论文_普通烟草CBL基因家族全基因组鉴定

来源:植物研究 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2022-01-10
作者:网站采编
关键词:
摘要:文章摘要:CBL基因家族是Ca 2+ 介导植物信号转导途径中的一个重要家族,在植物逆境胁迫响应、植株生长发育中起着关键作用,但烟草CBL基因家族缺乏系统性报道。本研究通过生物信息学

文章摘要:CBL基因家族是Ca2+介导植物信号转导途径中的一个重要家族,在植物逆境胁迫响应、植株生长发育中起着关键作用,但烟草CBL基因家族缺乏系统性报道。本研究通过生物信息学系统地分析了烟草CBL基因家族成员的蛋白理化性质、染色体定位、系统发育进化、基因结构、保守结构域、共线性、顺式作用元件和组织表达模式;结果表明:在普通烟草基因组鉴定出20个烟草CBL基因家族成员,分为3个亚族分别命名为Group A、Group B以及Group C、家族成员不均匀的分布在各条染色体上;CBL蛋白编码的氨基酸数为164~331 aa;相对分子质量在19.22~37.23 kD之间;理论等电点(pI)在4.55~5.31之间,可见NtCBLs蛋白基本呈现酸性蛋白。基因结构分析表明NtCBLs除NtCBL5以外均包含内含子和外显子,内含子介于7~9之间,预测的家族成员中均存在EF-hand结构域,鉴定出6个Motif。进化分析发现CBL基因家族可分为三个类群,整个家族中存在7个基因复制对,并且与拟南芥的CBL家族中的5个基因存在共线性。烟草CBL基因家族上游1 500 bp启动子序列里面存在多种类型的非生物胁迫响应顺式作用元件,成员间顺式元件的类型和数量存在差异,预测烟草CBL基因家族在植株抗逆中可能发挥作用。结合烟草表达数据库分析发现,部分家族成员如Group B亚族在组织表达特性有所差异,在花中表达量较高。研究结果首次鉴定并初步分析了烟草CBL基因家族成员,这为深入研究烟草CBL基因家族功能提供理论基础。

文章关键词:

论文分类号:S572

文章来源:《植物研究》 网址: http://www.zwyjzz.cn/qikandaodu/2022/0110/2243.html



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