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林业论文_陕甘花楸叶绿体基因组及其与爪瓣花楸
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摘要:文章摘要:采用高通量测序技术分析了陕甘花楸(Sorbus koehneana)的叶绿体全基因组,并探讨其与爪瓣花楸(S. unguiculata)的关系。陕甘花楸叶绿体基因组全长159 873 bp,GC含量为36.60%,呈典
文章摘要:采用高通量测序技术分析了陕甘花楸(Sorbus koehneana)的叶绿体全基因组,并探讨其与爪瓣花楸(S. unguiculata)的关系。陕甘花楸叶绿体基因组全长159 873 bp,GC含量为36.60%,呈典型的四分体结构,包含1个小单拷贝区(SSC,19 218 bp)、1个大单拷贝区(LSC,87 899 bp)和1对反向重复序列(IRa和IRb,26 378 bp);共注释到108个基因,包括76个蛋白编码基因,4个 rRNA 基因,28个 tRNA 基因;检测到47个简单重复序列(SSR)和48个分散重复序列(INE)。花楸属植物的叶绿体基因组在在大小、基因类型、密码子、内含子和GC含量等方面高度保守,但不同的重复序列和位于非编码区的12个变异热点区域可用作后续物种遗传多样性和亲缘关系研究。系统发育分析结果显示陕甘花楸位于花楸属复叶亚属,与爪瓣花楸和钝齿花楸(S. helenae)亲缘关系较近;不支持将爪瓣花楸作为陕甘花楸的异名处理,建议恢复爪瓣花楸物种名称。
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项目基金:《植物研究》 网址: http://www.zwyjzz.cn/qikandaodu/2021/1216/2158.html