园艺论文_尾叶紫薇全长转录组测序及微卫星标 - 植物研究杂志社投稿_期刊论文发表|版面费|电话|编辑部|论文发表- 植物研究

来稿应自觉遵守国家有关著作权法律法规，不得侵犯他人版权或其他权利，如果出现问题作者文责自负，而且本刊将依法追究侵权行为给本刊造成的损失责任。本刊对录用稿有修改、删节权。经本刊通知进行修改的稿件或被采用的稿件，作者必须保证本刊的独立发表权。一、投稿方式： 1、请从我刊官网直接投稿。 2、请从我编辑部编辑的推广链接进入我刊投审稿系统进行投稿。二、稿件著作权： 1、投稿人保证其向我刊所投之作品是其本人或与他人合作创作之成果，或对所投作品拥有合法的著作权，无第三人对其作品提出可成立之权利主张。 2、投稿人保证向我刊所投之稿件，尚未在任何媒体上发表。 3、投稿人保证其作品不含有违反宪法、法律及损害社会公共利益之内容。 4、投稿人向我刊所投之作品不得同时向第三方投送，即不允许一稿多投。 5、投稿人授予我刊享有作品专有使用权的方式包括但不限于：通过网络向公众传播、复制、摘编、表演、播放、展览、发行、摄制电影、电视、录像制品、录制录音制品、制作数字化制品、改编、翻译、注释、编辑，以及出版、许可其他媒体、网站及单位转载、摘编、播放、录制、翻译、注释、编辑、改编、摄制。 6、第5条所述之网络是指通过我刊官网。 7、投稿人委托我刊声明，未经我方许可，任何网站、媒体、组织不得转载、摘编其作品。

园艺论文_尾叶紫薇全长转录组测序及微卫星标

作者:

关键词:

摘要：

文章摘要:【目的】尾叶紫薇是培育香花紫薇的重要种质资源，目前花香功能基因的研究及已开发的SSR分子标记较少，无法满足分子育种研究需求。【方法】本研究采用PacBio sequel平台对尾叶紫薇三个开花时期混样进行全长转录组测序，通过公共数据库对Unigene进行功能注释，利用MISA软件检索全长转录组的SSR位点，Primer3批量设计SSR引物并检测。【结果】测序获得39 087条非冗余、高质量全长转录本，平均长度为2 109 bp，N50长度为2 427 bp，长度主要分布在500 ～ 4 000 bp。有38 559条序列（98.64%）获得功能注释，功能主要集中于细胞进程及代谢进程。其中参与花香相关萜类物质合成的有56个，参与脂肪酸衍生物合成的有922个。获得的16 425个SSR位点分布在12 060条序列中，平均每5.02 kb出现1个SSR序列，3 141条序列含有多个SSR位点。SSR位点主要重复类型是二核苷酸和三核苷酸，分别占所有SSR位点的41.95%和31.58%，重复基序类型有96种，AG/CT重复类型的出现频率最高。SSR的重复次数以5～15次为主，长度为10～86 bp，平均为16.84 bp。随机选取52对SSR引物进行PCR检测，有40对引物能产生与单一、清晰的条带，有效扩增率为76.92%。【结论】本研究获得了与花香物质合成相关基因序列和大量有效SSR标记，将为深入了解尾叶紫薇花香物质合成与代谢、紫薇属植物种质资源评价与保护、分子标记辅助育种等研究奠定基础。

文章关键词:尾叶紫薇,全长转录组,分子标记,SSR,

项目基金:“十三五”国家重点研发计划项目（2019YFD1001000）,国家自然科学基金青年科学基金项目（31500574）,《植物研究》网址: http://www.zwyjzz.cn/qikandaodu/2021/0902/1797.html